Temeljni cilj projekta “Cijepljenje – pravo izbora” iskazan je samim nazivom: postići ukidanje obaveze vakciniranja, odnosno zaštititi slobodu odlučivanja.

U svrhu postizanja osnovnog cilja projektom su zacrtane brojne aktivnosti usmjerene na informiranje javnosti kako o samom projektu tako i o pravnim, medicinskim, etičkim i drugim argumentima na temelju kojih je inicijativa i pokrenuta.